Három év háborúskodás után a szeparatisták foglyul ejtik Palpatine főkancellárt. Anakin és mestere Obi-Wan a főkancellár segítségére sietnek,és sikerül kiszabadítaniuk.Anakin megöli Dooku grófot, a droidhadsereg vezetőjét, így a fiú végre megkapja a régen áhított helyet a Jedi Tanácsban, azonban nem lehet mester. A Tanács azzal bízza meg Anakint, hogy tudja meg Palpatine szándékait, a kancellár hivatali ideje ugyanis lejárt, de még mindig nem akarja abbahagyni a háborút.

Padmé politikustársaival együtt próbűl harcolni a demokráciáért, de a Szenátus továbbra sem akar tárgyalni a szeparatistákkal. Padmé Anakin feleségeként titokban tartja terhességét, nehéz, sötét kelmékkel takarja gömbölyödő hasát, miközben segíteni próbál az egyre zavarodottabbá vált Anakinon, akit rémálmok gyötörnek Padmé haláláról.A két fiatal teljes titokban várja a babát,ugyanis a fiút kizárnák a Rendből, ha tudnák, hogy Padmé gyermeket vár Tőle. Ám Anakin rossz oldalra áll: Palpatine felfedi előtte a Sötét Oldal titkait, ugyanis a kancellár a régen keresett Sith Nagyúr. A fiú a Sötét Oldal szolgája lesz, mert elhiszi Palpatine meséjét arról a Sith Nagyúrról, aki egykor legyőzte a halált. A fiú ebben a hitben válik gyilkossá, mert hisz abban, hogy a Sötét Oldal erejével megmentheti Padmét. A lány Obi-Wan-tól szerez tudomást férje tetteiről, és Anakin után indul a Mustafarra. Anakin azonban az ellen fordul, akiért mindent feládozott: megfojta a lányt, majd megküdz mesterével, aki győzelmet arat. Az egykori rabszolgafiúcska, a Kiválasztott a lángok martalékává válik. Azonban Sidious megtalálja a fiút, és megmenti az életét.Darth Vader így nyeri el végső alakját: Anakinból géppel lélegző, fémsisakos robot lesz.

Eközben Padmé életet ad ikreinek, Luke-nak és Leia-nak, akiket Obi-Wan és Bail Organa szenátor helyez biztonságba. Padmé nem tudja feldolgozni szerelme tettét, és meghal. Obi-Wan Luke-kal a Tatooin-ra utazik, és mellette marad, míg Leia-t Organa szenátor fogadja örökbe.

A Galaxis békéjét évekkel később azonban pont a Jedi és a szenátornő gyermekei állítják helyre, akik megküzdenek a Birodalommal, és győzelmet aratnak.